아래아 같이 하면 되지 않을까요?
1~10000까지라면 range(1, 10000) 으로 처리하고..
텍스트를 읽어와서 $data값을 explode함수로 배열로
저장해서 비교해하는거죠...

in_array()함수를 사용해서 range()함수로 지정된 값들을
$data값과 비교해서 false를 반환하면 빠진수가 되겠죠?
그 값을 다시 $omit 라는 배열변수에 저장하면
그 배열에 들어있는 값이 결국 누락된 값이 되겠죠..?

<?php
$data=array(1,2,3,5,6,8,10,14,15);
$i=0;

foreach(range(1, 15) as $tmp)
{
if(!in_array($tmp, $data))
{
$omit[$i] =$tmp;
$i++;
}
}


echo "누락된 숫자는 아래와 같습니다<br>\n";

echo "<pre>\n";
print_r($omit);
echo "</pre>\n";

?>

출처 : Tong - 드렁크수달스님의 ■ PHP ■통