조세특례제한법에 의하여 소득세나 법인세를 면제 또는 감면받거나 세액공제를 받는 경우에는 소득세 또는 법인세를 신고·납부할 때 그 공제·감액세액의 10%를 농어촌특별세로 신고·납부하여야 합니다.
그러나 중소기업특별세액감면, 기술 및 인력개발을 위한 감면 등과 같이 농어촌특별세법상 비과세로 규정된 경우에는 농어촌특별세가 과세되지 않습니다.

나이트클럽 등 과세유흥장소를 영위하는 사업자나 귀금속 판매업자, 고급가구 등의 제조업자는 매월 특별소비세를 신고·납부하여야 합니다.

종합소득세 또는 법인세를 신고·납부할 때는 종합소득세 또는 법인세 산출세액의 10% 를 소득할 주민세로 시ㆍ군ㆍ구에 신고·납부하여야 합니다.
또한 근로소득, 특정의 사업소득, 기타소득, 이자소득, 배당소득, 퇴직소득 등에 대하여 소득세를 원천징수하는 경우에도 원천징수의무자는 원천징수하는 소득세액의 10%를 주민세로 징수하여 시ㆍ군ㆍ구에 납부합니다.

매년 8월 1일 기준으로 국내에 사업장을 둔 사업자는 균등할 주민세를 사업장 소재지 관할 시ㆍ군ㆍ구에 납부하여야 합니다.
개인사업자의 균등할 주민세는 50,000원으로서 직전연도 매출액이 4800만원 이상인 자에게만 적용되며, 법인사업자의 경우에는 자본금과 종업원수에 따라 50,000원에서 500,000원까지 부과됩니다.
균등할 주민세는 관할 시ㆍ군ㆍ구에서 사업자에게 고지서에 의하여 부과되며, 고지된 세액은 8월 31일까지 납부합니다.
균등할 주민세가 고지될 때는 주민세의 10%(인구 50만 이상의 시에서는 25%)에 상당하는 지방교육세도 같이 부과됩니다.

매년 7월 1일 현재 시ㆍ군ㆍ구에 건축물 연면적 330 입방미터(약 100평)를 넘는 사업소를 둔 경우에는 1 입방미터 당 250원의 재산할 사업소세가 과세되며, 이러한 사업자는 매년 7월 10일까지 재산할 사업소세를 사업장 소재지 관할 시ㆍ군ㆍ구에 신고·납부하여야 합니다.

제조업, 도ㆍ소매업, 건설업, 정보처리 및 컴퓨터운영관련업 등 중소기업 해당업종을 영위하는 사업자는 소득세 또는 법인세를 감면받습니다.
세액 감면율은 5%, 10%, 15%로서 기업규모 및 지역, 업종에 따라 달리 적용됩니다.

중소기업 해당업종을 영위하는 사업자로서 창업 후 2년 내에 벤처기업확인을 받은 기업이 소득세, 법인세 감면대상입니다.
세액 감면율은 50%이며 감면기간은 최초로 소득이 발생하는 과세연도부터 4년간입니다.
창업벤처중소기업감면은 창업 지역에 제한이 없지만 창업 후 2년 이내에 벤처기업확인을 받아야 감면대상이 되므로 이점 유의하여야 합니다.

신용카드, PㆍOㆍS(판매시점정보시스템), 전자상거래에 의한 매출액에 대해서는 소득세 신고시 전년 대비 수입금액증가액에 대한 세액 상당액의 50% 또는 당해연도의 수입금액에 대한 세액 상당액의 5%를 공제받습니다.
공제대상자는 신용카드가맹자, PㆍOㆍS설치자, 전자상거래를 영위하는 자로서 개인사업자에 한합니다.

투자세액공제란 사업용 자산이나 정보보호시스템 등을 취득하는 경우 그 취득금액의 일정율을 소득세나 법인세에서 공제해 주는 제도입니다.
투자세액공제 제도에는 임시투자세액공제, 중소기업투자세액공제, 특정설비투자세액공제, 연구ㆍ개발용설비투자세액공제, 생산성향상시설투자세액공제 등이 있으며, 업종이나 중소기업 여부 또는 투자대상 설비의 용도, 설치 지역에 따라 세액공제 여부 및 감면율이 달리 적용되는 경우가 있습니다.
따라서 사업자가 사업용 설비를 구입하거나 IT시스템(H/W, S/W 등) 등을 설치할 때는 투자세액공제 요건을 면밀히 검토하여 세제혜택 여부를 확인해 보는 것이 좋습니다.

연구 및 인력개발을 위한 비용을 지출하는 경우에는 당해 과세연도에 지출한 연구개발비의 15% 또는 당해연도 연구개발비 중 직전 4년간 지출한 연평균 연구개발비를 초과하는 금액의 50%(또는 40%) 상당액을 소득세 또는 법인세에서 공제받습니다.
세액공제 대상이 되는 연구ㆍ개발비는 기술개발비, 인력개발비 등 조세특례제한법에서 정하는 일정한 요건을 갖춘 지출에 한합니다.

개인사업자 중 간편장부대상자가 기장에 의하여 소득세 신고를 하면 연간 100만원 한도 내에서 소득세 산출세액의 10%를 공제받습니다.

신고하지 않은 소득에 상당하는 세액의 20%(또는 수입금액의 0.07%)에 해당하는 신고불성실가산세가 부과됩니다.

신고하지 아니한 납부세액 상당액에 대하여 10%의 신고불성실가산세가 부과됩니다.

미납세액에 대하여 1일에 0.03%(연 10.95%)의 납부불성실가산세가 적용됩니다.

원천징수세액의 10%를 원천징수납부불성실가산세로 납부하여야 합니다.

장부를 비치·기장하여야 하는 사업자가 장부를 비치·기장하지 않은 경우에는 산출세액의 20% 또는 수입금액의 0.07%에 해당하는 무기장가산세가 적용됩니다.
다만 직전연도의 수입금액이 4,800만원에 미달하는 개인사업자와 당해 과세기간에 신규로 사업을 개시한 개인사업자에 대해서는 무기장가산세 적용이 배제됩니다.

부가가치세 과세사업자로서 세금계산서를 교부하여야 하는 자가 세법이 정하는 공급시기에 세금계산서를 교부하지 않으면 그 공급가액에 대하여 1%의 세금계산서미교부가산세가 부과됩니다.

매출처별 세금계산서합계표를 제출하여야 하는 자가 부가가치세 과세표준 신고시 이를 제출하지 않은 경우에는 미제출금액에 대하여 1%의 세금계산서미제출가산세가 부과됩니다.

부가가치세 면세사업자로서 계산서를 교부하여야 하는 자가 그 교부시기에 계산서를 교부하지 않으면 당해 공급가액의 1%에 해당하는 계산서미교부가산세가 부과됩니다.

계산서합계표를 제출하여야 하는 자가 기한 내에 이를 제출하지 않으면 미제출금액의 1%에 해당하는 계산서합계표미제출가산세가 적용됩니다.

소득세법 또는 법인세법상 원천징수대상소득을 지급하는 원천징수의무자는 소득 또는 수입금액을 지급받는 자에게 교부한 원천징수영수증을 지급조서로 하여 관할세무서에 제출하여야 합니다.
지급조서를 제출하여야 하는 자가 기한 내에 이를 제출하지 않으면 지급금액의 2%에 상당하는 지급조서미제출가산세가 부과됩니다.
지급조서 제출기한은 지급일이 속하는 연도의 다음연도 2월 말일까지입니다.

정규지출증빙 수취대상 거래로서 정규지출증빙을 수취하여야 하는 자가 세금계산서, 계산서, 신용카드매출전표 등을 수취하지 않으면 수취하지 않은 금액에 대하여 2%의 증빙불비가산세가 부과됩니다.

사업연도 중에 주식 등의 변동사항이 있는 법인은 법인세 과세표준 신고기한 내에 「주식등변동사항명세서」를 제출하여야 하는데, 이를 기한 내에 하지 않으면 제출하지 않은 주식 등의 액면금액에 대하여 2%의 가산세가 부과됩니다.

과세표준과 세액을 신고하여야 하는 자가 이를 기한 내에 신고하지 않으면 관할세무서에서는 조사한 사실에 따라 과세표준과 세액을 결정하여 세액을 고지합니다.

착오, 실수, 기타 사유로 법정신고기한 내에 과세표준과 세액을 신고·납부하지 못한 경우에는 관할세무서에 「기한후과세표준신고서」를 제출할 수 있습니다.
기한후신고를 할 때는 과세표준신고액에 상당하는 세액과 세법에서 정하는 가산세를 같이 납부하면 됩니다.

자금사정으로 인하여 기한 내 세금 납부가 곤란한 경우에도 과세표준신고는 반드시 기한 내에 하는 것이 유리합니다.
왜냐하면 세금을 납부하지 않더라도 과세표준신고를 기한 내에 해 놓으면 나중에 세금을 낼 때 1일에 1만분의 3(연 10.95%)의 미납부가산세를 추가하여 납부하면 되지만, 과세표준신고를 기한 내에 하지 않으면 미납부가산세 외에 신고불성실가산세도 부담해야 하기 때문입니다.